ちなみにまだほとんど動かしてません。ドキュメントやソースを見ただけでの検討です。
ntwitter
まずはよく使われているntwitter。でも検討しない。なぜなら
DEPRECATED
This repository has been unmaintained for two years, is deprecated on npm, and should not be considered an authoritative source of anything. Sorry for the inconvenience.
AvianFlu/ntwitter
だから。
つづいて名前そのままの twitter 。Github だと desmondmorris/node-twitter なのだけど、npm には別の node-twitter があったりするのでとてもややこしい。
twit
そして twit 。
ドキュメントとしてはこれが一番しっかりしているようだし、Twitter API への対応もこれが一番な気がする。
例えば Streaming のときの message type の区別がしっかりされている。これは Streaming message types | Twitter Developers に載ってるのだけど、delete とか friends とかの通知。 twit はこれら通知のイベントをまとめて message で拾えるけど、全て別イベントとして区別出来る（ https://github.com/ttezel/twit/blob/master/lib/streaming-api-connection.js#L262 以降参照）。そして user stream の message も区別されている。
先に挙げた twitter では user stream の messageしか区別していない（ https://github.com/desmondmorris/node-twitter/blob/master/lib/parser.js#L39 参照）。
まとめ
ので個人的には twit を使っていきたいと思っています。
もちろん REST API 相手だと twit でも twitter でも get/post メソッドに REST API のパス、ツイート内容などを含むオプション、そしてコールバック関数、この３つを渡すという点は全く同じなので、使い方で比較出来るところはないと思います。
twitter のソースは非常に短い（ https://github.com/desmondmorris/node-twitter/tree/master/lib 参照）ですし、依存しているモジュールも request, deep-extend の二つだけなので、使う上で非常に軽いはずです。
